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새로운 말디토프 질량 분석 장비인 ASTA MicroIDSys의 임상 균주를 이용한 균종 동정 성능 평가

Other Titles
 Evaluation of the Performance of ASTA MicroIDSys, a Novel Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry System, in Identification of Bacterial Clinical Isolates 
Authors
 유창승  ;  이은정  ;  김도균  ;  정석훈 
Citation
 Annals of Clinical Microbiology, Vol.23(3) : 1-14, 2020-09 
Journal Title
Annals of Clinical Microbiology
ISSN
 2288-0585 
Issue Date
2020-09
Keywords
Bacterial identification ; Bruker Biotyper ; Matrix-assisted laser desorption/ ionization-time of flight mass spectrometry ; MicroIDSys
Abstract
배경: 최근 새로 출시된 말디토프 질량분석(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS) 장비인 ASTA MicroIDSys (ASTA, Korea)는 기존의 MALDITOF MS 장비들과 균종 동정 결과의 일치율이 높은 것으로 보고된 바 있다. 본 연구는 임상미생물 검사실에 의뢰되었던 검체에서 배양된 균주 전수를 대상으로 ASTA MicroIDSys와 Bruker Biotyper (Bruker Daltonics, Germany)의 균종 동정 성능을 비교하였다. 또한 MALDI-TOF MS 에서 균종 구별이 잘 되지 않는다고 알려져 있는 균속들에 대한 추가적인 평가를 통해, ASTA MicroIDSys의 유용성과 한계를 평가하고자 하였다. 방법: 총 889주의 임상 분리주를 ASTA MicroIDSys와 Bruker Biotyper로 각각 균종을 동정하여 결과를 비교하였다. 동정된 균종 또는 균속이 일치하지 않는 경우 해당 균주의 16S rRNA 염기서열분석을 통해 균종을 확인하였고, Acinetobacter 균속과 Klebsiella 균속, Burkholderia cepacia complex 에 해당되는 모든 균주는 rpoB 와 hisA, recA 유전자의 염기서열 분석을 통해 균종을 확정하였다. 결과: ASTA MicroIDSys의 균속 및 균종 일치율은 장내세균에서 100%와 98.3%, 포도당 비발효그람음성 막대균에서 98.8%와 91.0%, 그람양성 알균에서 100%와 100%, 기타 균주에서 98.9% 와 98.9%였다. 균종 동정 결과가 일치하지 않았던 균주는 Acinetobacter 균속, Burkholderia 균속, Klebsiella 균속, Enterobacter 균속 등이었으며, 총 23건의 불일치 균종 중 17건(73.9%)은 데이터베이스에 포함되지 않은 균종에 기인한 것이었다. 임상미생물 검사실에서 5년간 보고되었던 총108,251건 중 기존 보고 결과와 일치할 것으로 예측되는 균종 동정 건수는 106,018건(97.9%)이었다. 결론: ASTA MicroIDSys는 환자 검체에서 분리되는 임상적으로 중요한 대부분의 균종을 정확하게 동정하였으며 Bruker Biotyper와도 높은 동정 일치율을 보여 임상미생물 검사실에서 유용하게사용할 수 있을 것으로 판단된다.
DOI
10.5145/ACM.2020.23.3.3
Appears in Collections:
1. College of Medicine (의과대학) > Dept. of Laboratory Medicine (진단검사의학교실) > 1. Journal Papers
Yonsei Authors
Kim, Dokyun(김도균) ORCID logo https://orcid.org/0000-0002-0348-5440
Liu, Changseung(유창승) ORCID logo https://orcid.org/0000-0002-8777-7431
Jeong, Seok Hoon(정석훈) ORCID logo https://orcid.org/0000-0001-9290-897X
URI
https://ir.ymlib.yonsei.ac.kr/handle/22282913/182560
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