Distribution and characterization of carbapenemase-producing Pseudomonas aeruginosa in Korea

Abstract

2015년 국내의 29개 종합병원에서 총 431주의 임상 분리 녹농균을 수집하였다. 항균제 감수성 시험은 디스크 확산법을 사용하였고 카바페넴의 최소 억제 농도는 한천희석법으로 시험하였다. 카바페네메이즈 유전자들은 중합연쇄반응과 시퀀싱을 통해 증폭 및 확인하였고, 카바페네메이즈 유전자 카세트들 주변의 class I 인테그론 구조는 중합연쇄반응 지도화로 분석하였다. 시험 균주의 역학적 분류는 다좌위 서열 형별분석과 유전자 지문 분석법을 시행하였다. 그리고 blaIMP-6, blaIMP-10, 그리고 blaGES-24의 베타 락타메이즈 유전자를 가지고 있는 녹농균 내성섬을 분석하기 위해 전장 유전체 분석을 실시하였다. 카바페넴 비감수성 균주와 카바페네메이즈를 생성하는 녹농균 균주는 총 431주 중에서 각각 34.3% (148주) 와 9.5% (41주) 이었다. IMP-6는 가장 흔한 카바페네메이즈 유형이였고, 그 다음으로 VIM-2, IMP-10, 그리고 GES-24가 있었다. 모든 카바페네메이즈 유전자들은 염색체 상에 6개의 다른 유형을 가지는 class I 인테그론에 위치해 있었다. 또한 모든 카바페네메이즈 유전자를 가지는 균주들은 80% 이상의 유전자 지문 연관성을 가지고 있었다. 더욱이, 2균주의 244시퀀스 타입을 제외하고는 모두 235시퀀스 타입으로 확인되었다. blaIMP-6, blaIMP-10, 그리고 blaGES-24의 베타 락타메이즈 유전자들은 새롭게 발견된 녹농균 내성섬에 위치해 있었고, 본 연구에서 내성섬 -15와 -16이라고 명명하였다. 본 연구의 결과는 국내에서 IMP-6를 생산하는 235시퀀스 타입 녹농균의 분명한 클론 확산과 IMP-10과 GES-24의 출현으로 인한 국내 카바페네메이즈의 다양화를 나타내고 있다.