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Name :
Bhin, Jinhyuk [빈진혁]
Department :
College of Medicine (의과대학) - Dept. of Biomedical Systems Informatics (의생명시스템정보학교실)

교수 기본정보

세부 전공
암 유전체학, 생명정보학
이메일
jbhin@yuhs.ac

실험실 기본정보

이름
Cancer Genomics & Intelligence
위치
강남세브란스 미래의학연구센터
구분
Wet Lab ( %), Dry Lab (100%)

연구소개

연구 분야
연구 내용
① 대규모 전장 유전체 분석을 통한 암 진화 경로 및 클론 구조 규명
- 다중 변이 통합 분석: 대규모 코호트의 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 데이터를 활용하여 단일 염기 변이(SNV), 복제수 변이(CNA), 구조적 변이(Structural Rearrangement) 등 다양한 돌연변이 유형을 종합적으로 분석.
- 진화적 궤적 추적: 종양 내 이질성(Intratumoral Heterogeneity)과 클론 구조(Clonal Architecture)를 파악하고, 각 계통(Lineage) 특이적인 돌연변이 과정과 암 진행을 이끄는 선택적 압력(Selective Pressure)을 규명하여 암의 진화 경로를 지도화.

② 롱리드 시퀀싱 기반의 고해상도 구조 변이 및 숨겨진 드라이버 발굴
- 비전형적 변이 탐지: 기존 쇼트 리드(Short-read) 방식으로는 검출이 어려웠던 은닉된(Cryptic) 구조 변이와 복잡한 구조적 변이를 롱리드 시퀀싱 기술을 통해 정밀 식별.
- 기전 규명 및 일배체형 분석:
o 일배체형 재구성 (Haplotype Reconstruction): 변이를 개별 일배체형(Haplotype) 수준에서 위상 정렬(Phasing)하여 유전체 복잡성의 실체를 파악.
o 발암 기전 해석: 인핸서 하이재킹(Enhancer Hijacking), 조절 부위 재배선(Regulatory Rewiring), 융합 유전자(Oncogenic Fusions) 형성 등 종양 발생에 기여하는 복합적인 기전을 구체적으로 밝힘.

학생 참여 정보

학생들이 참여하면 좋을 연구
  • 1) 동일 유방암 환자 유래 원발암-전이암 쌍(Paired) 시료의 Long-read Sequencing 기반 정밀 유전체 구조 변이 분석 및 전이 진화 메커니즘 규명
  • 2) 대규모 전장유전체 데이터 기반 AI를 활용한 hotspot 변이 발굴을 통한 신규 드라이버 변이 발굴
  • 3) Xenium, VisiumHD 등 공간전사체 분석을 통한 종양미세환경의 항암제 예후 예측 인자 규명
  • 4) Bulk RNA-seq의 deconvolution 분석을 통한 원발암, 전이암의 전이 조직 특이적 종양미세환경 규명
학생 참여 시 사용하게 되는 장비 및 프로그램
  • 바이오빅데이터 분석 서버
  • (최대 CPU 계산노드 92 코어 x 4, 4TB RAM, GPU 최대 A100 x 4 사용 가능)
참여 전 준비사항
  • R, Python에 대한 기초 지식 혹은 데이터사이언스/유전체 연구에 대한 진지한 관심

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